1952年10月，由孙慎无等吕四地区有识之士募捐创建，定名为"私立海滨初级中学"。1956年8月转为公立学校，1957年更名为"启东县吕四初级中学"。1958年秋季，增设高中班，经省教育厅核准，更名为"启东县吕四中学"，在启东县属完全中学。1983年秋季开始，全校初，高中各稳定在24班。1990年2月学校更名为"启东市吕四中学"。1998年5月顺利通过南通市重点高中评估验收，6月4日升格为"南通市重点高中"，为致力办好高中教育而努力，同年秋与吕四港镇联办初中部，将初中部定为"鹤城初中"。2001年秋，终止联合办学，鹤城初中由吕四港镇管理。1998年秋，高中扩为6轨。2001年秋，高中又扩为8轨。2002年秋，开始高中稳定在10轨，2004年3月学校转评为江苏省二星级普通高中。2009年秋，高中扩为14轨，同时学校已接受了省教育评估院对我校申报三星级普通高中的评估验收。